Systèmes et techniques

Pour soutenir les équipes de recherche dans leur projets, la plateforme d'imagerie du CRBS propose plusieurs systèmes et techniques et offre la possiblité de réaliser des observations multi-échelles sur des échantillons fixés comme vivants.

Actuellement dotée de systèmes d'imagerie photonique, la plateforme a comme ambition de se pourvoir dans le futur de systèmes de microscopie électronique et corrélative.

Stéréomicroscopie

Zeiss Discovery V20

Loupe dotée d'un éclairage épiscopique en lumière blanche elle fonctionne sur une plage de grossissements de 7,5x à 150x correspondant à des champs de 31 mm à 1.5mm avec une résolution de 8.5 à 1.2 µm respectivement.

Le Discovery V20 est couplé à une caméra couleur Zeiss IcC1 de 1.4 mégapixels de 4.65 µm de côté.

Ce système est essentiellement destiné à l'imagerie en lumière blanche (pas de fluorescence) de petits organes, organismes.

 

Leica M651

Ce stéréomicroscope est essentiellement dédié à la microchirurgie. Monté sur un socle de haute stabilité il est orientable selon plusieurs axes de telle manière à le positionner à façon. Il offre une gramme de grossissments de 6x à 40x permettant l'observation d'échantillons de plusieurs centimètres de côté.

Une illumination épiscopique en lumière blanche est diponible (pas de fluorescence).

LE M651 est couplé à la caméra couleur Leica 290 HD de 3 mégapixels de 3.2 µm de côté.

Ce système est essentiellement dédié à la manipulation (dissection) de petits animaux entiers et à l'imagerie de gros objets.

 

Microscopie champ large

Zeiss Axio Imager M2 Apotome

Microscope droit motorisé (cubes + platine).

Lumière transmise : champ clair & DIC (10x, 20x, 63x).

Cubes de fluorescence pour l'observation des fluorochromes bleus (Dapi/Hoechst), vertes (Alexa488, GFP), rouges (DsRed, Alexa594) et rouges lointain (Cy5,Alexa 647).

Objectifs : 2.5x, 5x, 10x, 20x, 63x huile.

Caméra couleur Zeiss AxioCam ICc5 de 5 mégapixels de 3.45µm de côté (lumière transmise).

Caméra noir et blanc Hamamatsu Orca Flash 4.0 LT de 4 mégapixels de 6.5µm de côté (fluorescence).

Module apotome permettant de réaliser des images de meilleurs résolution spatiale et contraste.

 

Vidéomicroscope Zeiss Observer Z1

Microscope inversé motorisé avec contrôle envronnemental.

Lumière transmise : champ clair, contraste de phase (10x, 20x, 40x, 63) & DIC (63x).

Cubes de fluorescence pour l'observation des fluorochromes bleus (Dapi/Hoechst), vertes (Alexa488, GFP), rouges (DsRed, Alexa594) et rouges lointain (Cy5,Alexa 647).

Objectifs : 5x/0.12, 10x/0.25, 20x/0.3, 40x/0.5, 63x/0.75, 63x/1.4 huile.

Caméra monochrome Zeiss MRM de 1.4 mégapixels de 6.45µm de côté.

Leica DM 750

Microscope droit manuel.
Lumière transmise : champ clair.
Cubes de fluorescence pour l'observation des fluorochromes bleus (Dapi/Hoechst), vertes (Alexa488, GFP) et rouges (DsRed, Alexa594)).
Objectifs : 4x, 10x, 40x, 100x huile.
Caméra couleur Leica DFC 425 C de 5 mégapixels de 2.78 µm de côté.

Microscopie confocale

Zeiss LSM 800 AiryScan

Microscope inversé avec contrôle environnemental (T°, Co2, humidité), platine motorisée et maintien de focus (definit focus 2)

Colibri 5 à 4 LEDs (385, 475, 555 et 630 m) pour l'observation directe (aux occulaires).

Au niveau du microscope, 3 cubes de fluorescences installés pour l'observation directe de fluorochromes bleus (Dapi, Hoechst), verts (GFP, Alexa 488, FITC) et rouges (DsRed, mCherry, Alexa 594)

Lasers : 405, 488, 561 et 640 nm

Objectifs : 10x / 0.30, 20x / 0.8, 40x / 1.4 (DIC), 63x / 1.4 (DIC)

3 détecteurs sensibles GaAsPs dont un AiryScan (résolution spatiale améliorée d'un facteur 1.7) et 1 détecteur ESID pour la lumière transmise

Plusieurs inserts disponibles pour accueillir lames, pétri 35 mm, plaques multipuits, labteck/Ibidi

 

 

Leica TCS SP5 MP

Microscope inversé avec chambre thermostatée (T°, Co2, humidité), platine motorisée

EL6000 aux halogénures de mercure pour l'bservation directe.

Au niveau du microscope, 3 cubes de fluorescences installés pour l'observation directe de fluorochromes verts (GFP, Alexa 488, FITC) et rouges (DsRed, mCherry, Alexa 594)

Lasers uv & visibles : 405, 458, 476, 488, 496, 514, 543, 633 nm

Laser infrarouge pulsé Spectra Physics Mai Tai (de 710 à 990 nm)

Objectifs : 20x / 0.7, 20x / 0.75 (optimisé IR), 40x / 1.25, 63x / 1.4, 100x / 1.3.

3 photomultiplicateurs conventionnels + 1 détecteur pour la lumière transmise

2 détecteurs non descannés pour l'imagerie multiphotonique de sondes vertes et rouges (filtres d'émission FITC & mCherry)

Scanners conventionnel et résonnant (16000 Hz en bidirectionnel)

 

Spinning-disk Olympus Ixplore SPIN
Microscope inversé (widefield ou confocal rapide) avec contrôle environnemental (T°, Co2, humidité), platine motorisée et maintien de focus.
Coolled PE-4000 pour l'observation directe en fluorescence.
4 cubes de fluorescence pour l'observation en épifluorescence de fluorochromes bleus (Dapi, Hoechst), verts (GFP, Alexa 488, FITC), rouges (DsRed, mCherry, Alexa 594) et rouges lointain (CY5, Alexa 647).
Lasers : 405, 488, 561, 640 nm.
Tête spinning disk Yokogawa W1 avec miroir dichroique à 4 bandes (405-488-561-640) et 4 filtres d'arrêt (447/50, 525/50, 617/73,685/40).
Objectifs : 10x/0.4, 30x/1.05 (Silicone), 63x/1.2 (Water).
1 caméra monochrome ORCA-FUSION.

Traitement et analyse d'images

Station de traitement et d'analyse d'images contenant les logiciels suivants:

  • IMARIS (visualisation 3D, animations, tracking 3D +t, morphométrie 3D)
  • Fiji
  • Ilastik
  • Icy

Cette station offre différents plugins/macros développés par PIC-STRA pour ses utilisateurs.

Si vous souhaitez que nous vous installions un nouveau programme ou que nous vous développions un nouveau plugin de traitement et/ou d'analyse d'images, n'hésitez pas à nous contacter.